Кладрубская порода получила свое название от Кладрубского конного завода в Чехословакии, который был основан в 1572 г. Первоначально в нем разводили староиспанских лошадей. Завод поставлял парадных лошадей серой и вороной масти ко двору австро-венгерского императора, поэтому производящий состав никогда не был многочисленным. Лошади кладрубского завода были исключительно крупными, с высотой в холке 183 см и более, однако вынужденное родственное разведение привело к снижению роста. Поэтому в конце XVIII века в завод были поставлены неаполитанские жеребцы, и в течение полутора веков кладрубских лошадей разводили без прилития посторонней крови.
Начиная с 1921 г. серых кладрубских лошадей стали скрещивать с арабскими жеребцами типа шагия. Вороных кладрубских лошадей с 1938 г. разводят в отдельном хозяйстве невдалеке от Кладрубского конного завода.
Современные кладрубские лошади отличаются крупным ростом (167-178 см в холке), имеют характерный выпуклый профиль головы, длинную шею и корпус.
Кладрубские лошади участвуют в улучшении сельскохозяйственной и разъездной лошади. Они успешно применяются для выездки, но менее пригодны в конкурах и стипль-чезах.