На 1 января 2012 года в республике Саха (Якутия) имеется 17 племенных репродукторов РФ по разведению лошадей с поголовьем 8054 племенных лошадей, в том числе 4568 кобыл.
По сравнению с 2006 годом численность поголовья племенных лошадей сократилось на 646 голов (7,4%). На сегодняшний день удельный вес племенных лошадей составляет 4,7% от общего поголовья лошадей республики.
У якутских лошадей до 60-х годов прошлого столетия селекционная работа проводилась на повышение их рабоче-пользовательных качеств. В связи с повышением оснащенности сельскохозяйственного производства энерговооруженностью, а также увеличением количества автотранспорта, потребности народного хозяйства в конской тягловой силе намного сократились. Появились благоприятные условия для развития продуктивного направления в коневодстве Республики Саха (Якутия), т. е. для разведения лошадей якутской породы специально на производство мяса и молока.
По итогам 2011 года, в племенных хозяйствах республики деловой выход жеребят - 67,1%, сохранность взрослого поголовья - 93,6%. Наилучшие результаты по деловому выходу жеребят и сохранности взрослого поголовья добились: СПК «Тонор» Оймяконского улуса – 93,3% и 100% соответственно; НСХАКУ «Бараммат» Чурапчинского – 96,6% и 99,0%; СХПК «Кэскил» Намского улуса – 85,0% и 100%.
Условия зимовки, состояние кормов по зонам республики в связи с природно-климатическими условиями различные, и от этого во многом зависят производственные показатели племенных хозяйств.
Отметим, что повышенное минимальное требование Российской Федерации для отнесения к племенным предприятиям и нестабильность качественных показателей племенных предприятий республики являются основными причинами, по которым на сегодняшний день из 17 племенных предприятий федеральную субсидию на племенную кобылу получили только 2 коневодческих хозяйства (СХПК «Победа» Таттинского улуса и СПК «Чаппанда» Нюрбинского улуса).
Для совершенствования учета лошадей с 2009 года в племенных предприятиях республики внедряется электронный метод идентификации животных (микрочипирование), также создается база данных для племенного учета. За прошлый год в племенных хозяйствах республики микрочипировано всего 5 112 голов лошадей.